Das Kollegium Papio wurde 1584 von Kardinal Carlo Borromeo dank einer Erbschaft von Bartolomeo Papio, einem in Rom lebenden Patrizier aus Ascona, gegründet. Die jahrhundertelange Geschichte des Kollegs war sehr wechselvoll und sah die Abfolge zahlreicher Verwaltungen durch verschiedene Orden, zuletzt durch die Benediktiner von Einsiedeln (1924-1964), mit denen die lange päpstliche Periode zu Ende ging. Im Jahr 1965 ging das Kollegium an die Diözese Lugano über.